Bernard Katz lahir pada tanggal 26 Maret 1911 di Leipzig, Jerman. Ia adalah putra tunggal pasangan Rusia-Yahudi, Maz Katz dan Eugen Rabinowitz. Pendidikan pertamanya diperolehnya di Albert Gymnasium di Leipzig (1921-1929) kemudian dia mengambil studi kedokteran di University of Leipzig (1929-1934). Dia menerima penghargaan Siegfried Garten Prize untuk riset Fisiologis tahun 1933 dan meraih gelar M.D. pada tahun 1934.